La Universidad Austral de Chile, tiene más de 40 años de tradición en estudios de los cuerpos de agua dulce de Chile, creando una base de datos de la mayoría de los lagos y ríos del Sur de Chile. En el inicio, los estudios limnológicos se realizaron en el laboratorio del lago Riñihue. A partir del año 2001 se trasladó dicho laboratorio al actual, ubicado en el lago Panguipulli donde la UACh tiene un terreno en comodato con el Serviu Valdivia.

El laboratorio cuenta con un equipamiento para estudios biológicos y químicos, un sistema de flujo de agua continuo. Estas instalaciones permiten el desarrollo de actividades científicas, docentes y de difusión.