Francisco Salinas
Formación académica:
2008. Ingeniero en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile. Chile.
2011. Doctor en Microbiología, Universidad de Santiago de Chile. Chile.
2014. Postdoctorado, IRCAN, Nice, Francia.
2017. Postdoctorado, Pontificia Universidad Católica de Chile. Chile.
2017-2019. Investigador asociado, Universidad de Santiago de Chile, Santiago, Chile.
Interés Científico:
El interés científico de nuestro grupo de investigación es desarrollar nuevas herramientas de biología sintética para regular la transcripción en levaduras utilizando luz. Estos sistemas, denominados interruptores optogenéticos, permiten el control espacial y temporal de los procesos biológicos mediante la activación por luz. Adicionalmente, los interruptores optogenéticos tienen múltiples aplicaciones biotecnológicas debido a que permiten controlar por luz cualquier gen de interés en levadura, reemplazando a los inductores químicos en la producción de proteínas de alto valor comercial.
Por otra parte, nuestro grupo de investigación también está interesado en la genómica funcional, buscando entender el fenómeno de transferencia horizontal de genes en eucariontes. Este proceso biológico es de gran importancia para la adquisición de genes de resistencia a antibióticos en bacterias, sin embargo, en eucariontes existe poca información sobre las ventajas adaptativas que genera. En levaduras, se ha demostrado que la transferencia horizontal de genes ha sido fundamental en la adaptación a diferentes nichos ecológicos. De esta forma, estamos estudiando sistemáticamente los niveles de expresión y los niveles de proteínas asociados a genes adquiridos por transferencia horizontal en levaduras. Para ello, estamos utilizando diferentes herramientas de biología molecular (colecciones de mutantes, genes reporteros y proteínas fluorescentes), así como también, herramientas de biología sintética (CRISPR-Cas9 e interruptores optogenéticos).
Proyectos:
2025-2029. FONDECYT regular 1250815. Unraveling genetic factors in alcohol yeast efficiency through multi-omics analysis. Co-investigador.
2022-2027. Millenium Institute for Integrative Biology (iBio), Iniciativa Científica Milenio. Investigador adjunto.
2022-2026. FONDECYT regular 1220026. Genomic and transcriptional profiling of fermentative vigor in laboratory lager yeast hybrids. Co-investigador.
2021-2025. FONDECYT regular 1210955. Combining synthetic biology approaches for the reversible and simultaneous transcriptional control of multiple metabolic genes in yeast. Investigador responsable.
Publicaciones:
- Ruiz, D., Inzunza, C., Barría, J., Baeza, C., Molina, A., Cubillos, FA., Salinas, F. (2025). Optogenetic Modification of Glycerol Production in Wine Yeast. ACS Synth. Biol.
- Figueroa, D., Ruiz, D., Tellini, N., De Chiara, M., Kessi-Pérez, EI., Martínez, C., Liti, G., Querol, A., Guillamón, JM., Salinas, F. (2025). Optogenetic control of horizontally acquired genes prevent stuck fermentations in yeast. Spectr. 13(2):e0179424.
- Rocha, G., Gómez, M., Baeza, C., Salinas, F., Martínez, C., Kessi-Pérez, EI. (2024). Phenotyping of a new yeast mapping population reveals differences in the activation of the TORC1 signalling pathway between wild and domesticated yeast strains. Biol. Res. 57(1):82.
- Guerrero, M., Ruiz, C., Romero, A., Robeson, L., Ruiz, D., Salinas, F. (2023). The N-Terminal Region of the BcWCL1 Photoreceptor Is Necessary for Self-Dimerization and Transcriptional Activation upon Light Stimulation in Yeast. J. Mol. Sci. 24(15): 11874.
- Kessi-Pérez, EI., Acuña, E., Bastías, C., Fundora, L., Villalobos-Cid, M., Romero, A., Khaiwal, S., De Chiara, M., Liti, G., Salinas, F., Martínez C. (2023). Single nucleotide polymorphisms associated with wine fermentation and adaptation to nitrogen limitation in wild and domesticated yeast strains. Biol. Res. 56(1): 43.
- Figueroa D, Baeza C, Ruiz D, Inzunza C, Romero A, Toro R, Salinas F. (2022). Expanding the molecular versatility of an optogenetic switch in yeast. Front. Bioeng. Biotechnol. 10: 1029217.
- Rojas, V., Salinas, F., Romero, A., Larrondo, LF., Canessa, P. (2022). Interactions between Core Elements of the Botrytis cinerea Circadian Clock Are Modulated by Light and Different Protein Domains. J. Fungi (Basel). 8(5): 486.
- Molinet, J., Urbina, K., Villegas, C., Abarca, V., Oporto, CI., Villarreal, P., Villarroel, CA., Salinas, F., Nespolo, RF., Cubillos, FA. (2022). A Saccharomyces eubayanus haploid resource for research studies. Sci. Rep. 12(1): 5976.
- Romero, A., Rojas, V., Delgado, V., Salinas, F., Larrondo, LF. (2021). Modular and molecular optimization of a LOV (Light-Oxygen-Voltage)-Based optogenetic switch in yeast. Int. J. Mol. Sci. 22(16): 8538.
- Figueroa, D., Rojas, V., Romero, A., Larrondo, L. F., Salinas, F. (2021). The rise and shine of yeast optogenetics. Yeast. 38(2): 131–146.
- Villalobos-Cid, M., Salinas, F., Inostroza-Ponta, M. (2020). Total evidence or taxonomic congruence? A comparison of methods for combining biological evidence. J. Bioinform. Comput. Biol. 18(06), 2050040–17.
- Molinet, J., Salinas, F., Guillamón, J. M., Martinez, C. (2020). GTR1 Affects Nitrogen Consumption and TORC1 Activity in Saccharomyces cerevisiae Under Fermentation Conditions. Genet. 11: 519.
- Kessi-Pérez, E. I., Ponce, B., Li, J., Molinet, J., Baeza, C., Figueroa, D., Bastias, C., Gaete, M., Liti, G., Díaz-Barrera, A., Salinas, F., Martinez, C. (2020). Differential Gene Expression and Allele Frequency Changes Favour Adaptation of a Heterogeneous Yeast Population to Nitrogen-Limited Fermentations. Microbiol. 11: 1204.
- Devia, J., Bastías, C., Kessi-Pérez, E. I., Villarroel, C. A., De Chiara, M., Cubillos, F. A., Liti, G., Martinez, C., Salinas F. (2020). Transcriptional Activity and Protein Levels of Horizontally Acquired Genes in Yeast Reveal Hallmarks of Adaptation to Fermentative Environments. Genet. 11: 293.
- Villalobos-Cid, M., Salinas, F., Kessi-Pérez, E. I., De Chiara, M., Liti, G., Inostroza-Ponta, M., Martinez, C. (2020). Comparison of Phylogenetic Tree Topologies for Nitrogen Associated Genes Partially Reconstruct the Evolutionary History of Saccharomyces cerevisiae. Microorganisms. 8(1): 32.
Responsable:
| BIMI055-20 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI063-21 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI225-16 | BIOLOGÍA MOLECULAR |
Colaborador:
| BIMI030-15 | BIOLOGIA CELULAR |
| BIMI065-18 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI075-16 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI165-15 | MICROBIOLOGÍA GENERAL |
| BIMI235-21 | BIOLOGÍA CELULAR MOLECULAR |
| BIMI304-15 | BIOQUIMICA APLICADA |
| BIMI132-19 | MICROBIOLOGÍA |
| BIMI135-16 | BASES MOLECULARES APLICADAS AL DIAGNÓSTICO |
| BIMI245-21 | BIOTECNOLOGÍA MOLECULAR |
| BIMI340-14 | DIAGNÓSTICO BIOQUIMICO AVANZADO |
Líneas de Investigación:
- Genómica funcional y transferencia horizontal de genes en levaduras.
- Control transcripcional y optogenética en levaduras.
Integrantes de grupo:
Diego Ruiz (PhD student)
Andrés Romero (PhD student)
Matías Guerrero (PhD student)
Claudia Inzunza (PhD student)
Colaboradores:
Dr. Luis Larrondo (PUC, Chile)
Dr. Gianni Liti (IRCAN, France)
Dr. Claudio Martínez (USACH, Chile)
Dr. Francisco Cubillos (USACH, Chile)
Dr. Manuel Vilalobos-Cid (USACH, Chile)
Dr. Eduardo I. Kessi-Pérez (USACH, Chile)
Contacto:
Fono: +56-63-2221907
Email: francisco.salinas@uach.cl
Instituto de Bioquímica y Microbiología
Campus Isla Teja / Valdivia
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