Francisco Salinas
Formación académica:
2008. Ingeniero en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile. Chile.
2011. Doctor en Microbiología, Universidad de Santiago de Chile. Chile.
2014. Postdoctorado, IRCAN, Nice, Francia.
2017. Postdoctorado, Pontificia Universidad Católica de Chile. Chile.
2017-2019. Investigador asociado, Universidad de Santiago de Chile, Santiago, Chile.
Interés Científico:
El interés científico de nuestro grupo de investigación es desarrollar nuevas herramientas de biología sintética para regular la transcripción en levaduras utilizando luz. Estos sistemas, denominados interruptores optogenéticos, permiten el control espacial y temporal de los procesos biológicos mediante la activación por luz. Adicionalmente, los interruptores optogenéticos tienen múltiples aplicaciones biotecnológicas debido a que permiten controlar por luz cualquier gen de interés en levadura, reemplazando a los inductores químicos en la producción de proteínas de alto valor comercial.
Por otra parte, nuestro grupo de investigación también está interesado en la genómica funcional, buscando entender el fenómeno de transferencia horizontal de genes en eucariontes. Este proceso biológico es de gran importancia para la adquisición de genes de resistencia a antibióticos en bacterias, sin embargo, en eucariontes existe poca información sobre las ventajas adaptativas que genera. En levaduras, se ha demostrado que la transferencia horizontal de genes ha sido fundamental en la adaptación a diferentes nichos ecológicos. De esta forma, estamos estudiando sistemáticamente los niveles de expresión y los niveles de proteínas asociados a genes adquiridos por transferencia horizontal en levaduras. Para ello, estamos utilizando diferentes herramientas de biología molecular (colecciones de mutantes, genes reporteros y proteínas fluorescentes), así como también, herramientas de biología sintética (CRISPR-Cas9 e interruptores optogenéticos).
Proyectos:
2022-2027. Millenium Institute for Integrative Biology (iBio), Iniciativa Científica Milenio. Investigador adjunto.
2022-2026. FONDECYT regular 1220026. Genomic and transcriptional profiling of fermentative vigor in laboratory lager yeast hybrids. Co-investigador.
2021-2025. FONDECYT regular 1210955. Combining synthetic biology approaches for the reversible and simultaneous transcriptional control of multiple metabolic genes in yeast. Investigador responsable.
2020-2024. FONDECYT regular 1201104. Exploiting the wild genetic diversity of Saccharomyces cerevisiae for wine production. Co-investigador.
Publicaciones:
- Guerrero, M., Ruiz, C., Romero, A., Robeson, L., Ruiz, D., Salinas, F. (2023). The N-Terminal Region of the BcWCL1 Photoreceptor Is Necessary for Self-Dimerization and Transcriptional Activation upon Light Stimulation in Yeast. Int. J. Mol. Sci. 24(15): 11874.
- Kessi-Pérez, EI., Acuña, E., Bastías, C., Fundora, L., Villalobos-Cid, M., Romero, A., Khaiwal, S., De Chiara, M., Liti, G., Salinas, F., Martínez C. (2023). Single nucleotide polymorphisms associated with wine fermentation and adaptation to nitrogen limitation in wild and domesticated yeast strains. Biol. Res. 56(1): 43.
- Figueroa, D., Baeza, C., Ruiz, D., Inzunza, C., Romero, A., Toro, R., Salinas, F. (2022). Expanding the molecular versatility of an optogenetic switch in yeast. Front. Bioeng. Biotechnol. 10: 1029217.
- Rojas, V., Salinas F., Romero, A., Larrondo, LF., Canessa, P. (2022). Interactions between core elements of the Botrytis cinereacircadian clock are modulated by light and different protein domains. Journal of Fungi. 8(5): 486.
- Molinet, J., Urbina, K., Villegas, C., Abarca, V., Oporto, CI., Villarreal, P., Villarroel, CA., Salinas, F, Nespolo, RF., Cubillos, FA. (2022). A Saccharomyces eubayanus haploid resource for research studies. Scientific reports. 12(1): 5976.
- Romero, A., Rojas, V., Delgado, V., Salinas, F., Larrondo, LF. (2021). Modular and Molecular Optimization of a LOV (Light-Oxygen-Voltage)-Based Optogenetic Switch in Yeast. International Journal of Molecular Science. 22(16): 8538.
- Figueroa, D., Rojas, V., Romero, A., Larrondo, L. F., Salinas, F. (2021). The rise and shine of yeast optogenetics. 287(546), 9901–16.
- Villalobos-Cid, M., Salinas, F., Inostroza-Ponta, M. (2020). Total evidence or taxonomic congruence? A comparison of methods for combining biological evidence. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 18(06), 2050040–17.
- Molinet, J., Salinas, F., Guillamón, J. M., Martinez, C. (2020). GTR1 Affects Nitrogen Consumption and TORC1 Activity in Saccharomyces cerevisiae Under Fermentation Conditions. Frontiers in Genetics. 11, 519.
- Kessi-Pérez, E. I., Ponce, B., Li, J., Molinet, J., Baeza, C., Figueroa, D., Bastias, C., Gaete, M., Liti, G., Díaz-Barrera, A., Salinas, F., Martinez, C. (2020). Differential Gene Expression and Allele Frequency Changes Favour Adaptation of a Heterogeneous Yeast Population to Nitrogen-Limited Fermentations. Frontiers in Microbiology. 11, 1204.
- Devia, J., Bastías, C., Kessi-Pérez, E. I., Villarroel, C. A., De Chiara, M., Cubillos, F. A., Liti, G., Martinez, C., Salinas F. (2020). Transcriptional Activity and Protein Levels of Horizontally Acquired Genes in Yeast Reveal Hallmarks of Adaptation to Fermentative Environments. Frontiers in Genetics. 11, 293.
- Villalobos-Cid, M., Salinas, F., Kessi-Pérez, E. I., De Chiara, M., Liti, G., Inostroza-Ponta, M., Martinez, C. (2020). Comparison of Phylogenetic Tree Topologies for Nitrogen Associated Genes Partially Reconstruct the Evolutionary History of Saccharomyces cerevisiae. Microorganisms. 8, 32.
- Kessi-Pérez, E. I., Salinas, F., González, A., Ying, S., Guillamón, J. M., Hall, MN., Larrondo, L. F., Martínez, C. (2019).KAE1Allelic Variants Affect TORC1 Activation and Fermentation Kinetics in Saccharomyces cerevisiae. Frontiers in Microbiology. 10:1686.
- Molinet, J., Cubillos, FA., Salinas, F., Liti, G., Martínez, C. (2019). Genetic variants of TORC1 signaling pathway affect nitrogen consumption in Saccharomyces cerevisiaeduring alcoholic fermentation. PLoS One. 14(7):e0220515.
- Kessi-Pérez, E. I., Salinas, F., Molinet, J., González, A., Muñiz, S., Guillamón, J. M., Hall, M. N., Larrondo, L. F., Martínez, C. (2019). Indirect monitoring of TORC1 signalling pathway reveals molecular diversity among different yeast strains. Yeast. 36(1):65-74.
Responsable:
| BIMI055-20 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI063-21 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI225-16 | BIOLOGÍA MOLECULAR |
Colaborador:
| BIMI030-15 | BIOLOGIA CELULAR |
| BIMI065-18 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI075-16 | BIOLOGÍA CELULAR |
| BIMI165-15 | MICROBIOLOGÍA GENERAL |
| BIMI235-21 | BIOLOGÍA CELULAR MOLECULAR |
| BIMI304-15 | BIOQUIMICA APLICADA |
| BIMI132-19 | MICROBIOLOGÍA |
| BIMI135-16 | BASES MOLECULARES APLICADAS AL DIAGNÓSTICO |
| BIMI245-21 | BIOTECNOLOGÍA MOLECULAR |
| BIMI340-14 | DIAGNÓSTICO BIOQUIMICO AVANZADO |
Líneas de Investigación:
- Genómica funcional y transferencia horizontal de genes en levaduras.
- Control transcripcional y optogenética en levaduras.
Integrantes de grupo:
Diego Ruiz (Research assistant)
Camila Baeza (PhD student)
David Figueroa (PhD student)
Andrés Romero (PhD student)
Matías Guerrero (PhD student)
Claudia Inzulza (undergraduate student)
Carlos Ruiz (undergraduate student)
Javiera Barria (undergraduate student)
Gonzalo Monsálvez (undergraduate student)
Colaboradores:
Dr. Luis Larrondo (PUC, Chile)
Dr. Gianni Liti (IRCAN, France)
Dr. Claudio Martínez (USACH, Chile)
Dr. Francisco Cubillos (USACH, Chile)
Dr. Manuel Vilalobos-Cid (USACH, Chile)
Dr. Eduardo I. Kessi-Pérez (USACH, Chile)
Contacto:
Fono: +56-63-2221907
Email: francisco.salinas@uach.cl
Instituto de Bioquímica y Microbiología
Campus Isla Teja / Valdivia
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