Sigifredo Garnica
Formación Académica:
Postdoctorado, Universidad de Tubinga, Tuebingen, Alemania, 2002 – 2006.
Dr. rer. nat., Universidad de Tubinga, Tuebingen, Alemania, 26/09/2002.
Magister en Ciencias Mención Microbiología, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile, 17/01/1996.
Licenciatura en Ciencias Biológicas, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile, 03/03/1993.
Interés científico:
Mi actual investigación busca dilucidar el rol de los factores medioambientales en determinar biodiversidad, distribución y composición de los hongos asociados con plantas desde diferentes ecosistemas manejados y naturales. Además, analiza los efectos de seleccionados factores bióticos y abióticos bajo condiciones controladas (función ecológica). Dependiendo del tipo de estudio realizamos toma de muestras desde ecosistemas sometidos a diferentes tipos de usos agrícolas y forestales, experimentos en el laboratorio y/o invernadero y aplicamos los más modernos métodos moleculares y análisis de datos actualmente usados en estudios ecológicos.
Seleccionadas publicaciones:
Riess K, Schön ME, Ziegler R, Lutz M, Shivas RG, Piątek M, Garnica S (2019) The origin and diversification of the Entorrhizales: deep evolutionary roots but recent speciation with a phylogenetic and phenotypic split between associates of the Cyperaceae and Juncaceae. Organisms Diversity & Evolution https://doi.org/10.1007/s13127-018-0384-4.
Zamora et al. (2018) Considerations and consequences of allowing DNA sequence data as types of fungal taxa. IMA Fungus (1):167–175. doi:10.5598/imafungus.2018.09.01.10
Schon ME, Nieselt K, Garnica S (2018) Belowground fungal community diversity and composition associated with Norway spruce along an altitudinal gradient. PLoS ONE 13(12): e0208493. https://doi.org/10.1371/journal. pone.0208493.
Garnica S, Riess K, Schön ME, Oberwinkler F, Setaro SD (2016). Divergence times and phylogenetic patterns of Sebacinales, a highly diverse and widespread fungal lineage. PLoS ONE doi:10.1371/journal.pone.0149531.
Riess K, Schön ME, Lutz M, Butin H, Oberwinkler F, Garnica S (2016). On the evolutionary history of Uleiella chilensis, a smut fungus parasite of Araucaria araucana in South America: Uleiellales ord. nov. in Ustilaginomycetes. PLoS ONE 11(1): e0147107. doi:10.1371/journal.pone.0147107.
Garnica S, Schön ME, Abarenkov K, Riess K, Liimatainen K, Niskanen T, Balint D, Soop K, Froeslev T, Jeppesen T, Peintner U, Brandrud TE, Saar G, Oertel B, Ammirati J (2016). Determining threshold values for barcoding fungi: lessons from Cortinarius (Basidiomycota), a highly diverse and widespread ectomycorrhizal genus. FEMS Microbiology Ecology 92, doi:10.1093/femsec/fiw045.
Bauer R, Garnica S, Riess K, Oberwinkler F, Weiss M, Begerow D (2015). Entorrhizomycota: a new fungal phylum reveals new perspectives on the evolution of fungi. PLoS ONE 10(7): e0128183.
Riess K, Oberwinkler F, Bauer R, Garnica S (2014). Communities of endophytic Sebacinales associated with roots of herbaceous plants in agricultural and grassland ecosystems are dominated by Serendipita herbamans sp. nov. PLoS ONE 9(4): e94676. doi:10.1371/journal.pone.0094676.
Responsable:
BIOQ231-08 | GENOMICA Y PROTEOMICA |
MICR240-90 | MICOLOGIA |
MICR323-90 | MICOLOGIA GENERAL |
Colaborador:
BIMI155-21 | MICROBIOLOGÍA |
BIMI165-15 | MICROBIOLOGÍA GENERAL |
BIMI118-16 | MICROBIOLOGÍA |
BIMI135-16 | BASES MOLECULARES APLICADAS AL DIAGNÓSTICO |
BIMI172-18 | MICROBIOLOGÍA |
BIMI180-16 | BIOMEDICINA Y FARMACOLOGÍA |
BIMI340-14 | DIAGNÓSTICO BIOQUIMICO AVANZADO |
Líneas de investigación:
Mi investigación intenta dilucidar de como factores bióticos y abióticos influencian la biodiversidad, distribución y composición de las comunidades de hongos asociados con plantas tanto en ecosistemas manejados y naturales, incluyendo los efectos de las interacciones planta-hongo bajo condiciones experimentales controladas. Esta comprende las siguientes tres líneas: (1) la historia evolutiva y biogeografía de las asociaciones entre hongos y plantas; (2) la biodiversidad, distribución y composición de las comunidades de hongos; y (3) experimentos in vitro y en invernadero de las interacciones hongos y plantas.
Actualmente, tenemos proyectos de investigación con el Prof. Oliver Bossdorf de la Universidad de Tubinga (http://www.uni-tuebingen.de/plantevoeco) y el PD Dr. Frank Waller de la Universidad of Wuerzburgo (https://www.biozentrum.uni-wuerzburg.de/pbio/abteilung-prof-dr-martin-j-mueller/waller10/) en Alemania. En la UACh colaboro con los colegas Dr. Oscar Martínez (oscar.martinez@uach.cl) y Dr. Máximo Alonso (máximo.alonso@uach.cl) en un proyecto FIC. Además con colegas del INFOR, la Universidad de Concepción y la Fundación Fungi estas trabajando en un proyecto FIA.
Contacto:
E-Mail: sigisfredo.garnica@uach.cl
Fono: +56 63 293849
Dirección: Instituto de Bioquímica y Microbiología
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