Formación Académica:

Postdoctorado, Universidad de Tubinga, Tuebingen, Alemania, 2002 – 2006.

Dr. rer. nat., Universidad de Tubinga, Tuebingen, Alemania, 26/09/2002.

Magister en Ciencias Mención Microbiología, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile, 17/01/1996.

Licenciatura en Ciencias Biológicas, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile, 03/03/1993.

Interés científico:

Mi investigación actual busca dilucidar el rol de los factores medioambientales en la determinación de la biodiversidad, distribución y composición de los hongos asociados a plantas en diversos ecosistemas, tanto manejados como naturales. Además, analiza los efectos de determinados factores bióticos y abióticos bajo condiciones controladas, enfocándose en su función ecológica. Dependiendo del tipo de estudio, realizamos muestreos en ecosistemas sometidos a distintos usos agrícolas y forestales, así como experimentos en laboratorio, invernadero y/o campo. Para ello, aplicamos los métodos moleculares más modernos y herramientas de análisis de datos comúnmente utilizados en estudios ecológicos. En nuestro laboratorio, recientemente estamos explorando aplicaciones biotecnológicas de hongos provenientes de la Antártica y de la Selva Valdiviana.

Seleccionadas publicaciones:

Garnica S., Soto-Rauch G., Leffler EM., Núñez C., Gómez-Espinoza J., Romero E., et al. 2025. High diversity of fungal ecological groups from ice-free pristine and disturbed areas in the Fildes Peninsula, King George Island, Antarctica. PLoS ONE 20(1): e0317571. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317571

Kim JS., Romero E., Cho Y., Ahumada-Rudolph R., Núñez C., Gómez-Espinoza J., Moya-Elizondo E., Garnica S., Lim YW., Cabrera-Pardo JR. 2025. Fungal diversity from Fildes Peninsula (Antarctica) and their antibiosis bioactivity against two plant pathogens. Journal of Microbiology 63(5): e2411029. https://doi.org/10.71150/jm.2411029

Gómez-Espinoza J., Riquelme C., Romero-Villegas E., Ahumada-Rudolph R., Novoa V., Méndez P., Millar C.Fernández-Alarcón N., Garnica S., Rajchenberg M., Cabrera-Pardo, JR. 2023. Diversity of Agaricomycetes in southern South America and their bioactive natural products. Natural Product Research 38(19): 3389–3403.https://doi.org/10.1080/14786419.2023.2244126

Schön ME., Zuern S., Vera M., Garnica S. 2023. High diversity of fungal ecological groups in Andean–Patagonian Nothofagus forests. PLoS ONE 18(8): e0290398. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0290398

Hackel, J., Henkel, T., Moreau, P., De crop, E., Verbeken, A., Sa, M., Buyck, B., Neves, M., Vasco-Palacios, A., Wartchow, F., Schimann, H., Carriconde, F., Garnica, S., Courtecuisse, R., Gardes, M., Manzi, S., Louisanna, E., Roy, M. 2022. Biogeographic history of a large clade of ectomycorrhizal fungi, the Russulaceae, in the Neotropics and adjacent regions. New Phytologist 236: 698–713. https://doi.org/10.1111/nph.18365

Vera M., Zuern S., Henríquez-Valencia C., Loncoman C., Canales J., Waller F., Basoalto E., Garnica S. 2022. Exploring interactions between Beauveria and Metarhizium strains through co-inoculation and responses of perennial ryegrass in a one-year trial. PeerJ 10: e12924 https://doi.org/10.7717/peerj.12924

Schön, M. E., Abarenkov, K., Garnica, S. 2022. Host generalists dominate fungal communities associated with alpine knotweed roots: a study of Sebacinales. PeerJ 10: e14047. https://doi.org/10.7717/peerj.14047

Garnica, S., Liao, Z., Hamard, S. et al. 2022. Environmental stress determines the colonization and impact of an endophytic fungus on invasive knotweed. Biological Invasions 24:1785–1795. https://doi.org/10.1007/s10530-022-02749-y

Garnica, S., Sandoval-leiva, P., Riess, K. 2021. Phylogenetic relationships in the genus Podoserpula and description of P. aliweni, a new species from Chile. Mycologia 113: 1110–1121. https://doi.org/10.1080/00275514.2021.1927422

Garnica S., Rosenstein R., Schön ME. 2020. Belowground fungal community diversity, composition and ecological functionality associated with winter wheat in conventional and organic agricultural systems. PeerJ 8: e9732 https://doi.org/10.7717/peerj.9732

Riess K, Schön ME, Ziegler R, Lutz M, Shivas RG, Piątek M, Garnica S (2019) The origin and diversification of the Entorrhizales: deep evolutionary roots but recent speciation with a phylogenetic and phenotypic split between associates of the Cyperaceae and Juncaceae. Organisms Diversity & Evolution https://doi.org/10.1007/s13127-018-0384-4.

Zamora et al. (2018) Considerations and consequences of allowing DNA sequence data as types of fungal taxa. IMA Fungus (1):167–175. doi:10.5598/imafungus.2018.09.01.10

Schon ME, Nieselt K, Garnica S (2018) Belowground fungal community diversity and composition associated with Norway spruce along an altitudinal gradient. PLoS ONE 13(12): e0208493. https://doi.org/10.1371/journal. pone.0208493.

Garnica S, Riess K, Schön ME, Oberwinkler F, Setaro SD (2016). Divergence times and phylogenetic patterns of Sebacinales, a highly diverse and widespread fungal lineage. PLoS ONE doi:10.1371/journal.pone.0149531.

Riess K, Schön ME, Lutz M, Butin H, Oberwinkler F, Garnica S (2016). On the evolutionary history of Uleiella chilensis, a smut fungus parasite of Araucaria araucana in South America: Uleiellales ord. nov. in Ustilaginomycetes. PLoS ONE 11(1): e0147107. doi:10.1371/journal.pone.0147107.

Garnica S, Schön ME, Abarenkov K, Riess K, Liimatainen K, Niskanen T, Balint D, Soop K, Froeslev T, Jeppesen T, Peintner U, Brandrud TE, Saar G, Oertel B, Ammirati J (2016). Determining threshold values for barcoding fungi: lessons from Cortinarius (Basidiomycota), a highly diverse and widespread ectomycorrhizal genus. FEMS Microbiology Ecology 92, doi:10.1093/femsec/fiw045.

Bauer R, Garnica S, Riess K, Oberwinkler F, Weiss M, Begerow D (2015). Entorrhizomycota: a new fungal phylum reveals new perspectives on the evolution of fungi. PLoS ONE 10(7): e0128183.

Riess K, Oberwinkler F, Bauer R, Garnica S (2014). Communities of endophytic Sebacinales associated with roots of herbaceous plants in agricultural and grassland ecosystems are dominated by Serendipita herbamans sp. nov. PLoS ONE 9(4): e94676. doi:10.1371/journal.pone.0094676.

Responsable:

Colaborador:

Líneas de investigación:

Mi investigación busca dilucidar cómo los factores bióticos y abióticos influyen en la biodiversidad, distribución y composición de las comunidades de hongos asociados a plantas, tanto en ecosistemas manejados como naturales. Esto incluye el estudio de las interacciones planta-hongo bajo condiciones experimentales controladas y semi-controladas. El trabajo se organiza en tres líneas principales: (1) la historia evolutiva y biogeografía de las asociaciones entre hongos y plantas; (2) la biodiversidad, distribución y composición de las comunidades fúngicas; y (3) experimentos in vitro, en invernadero y en campo sobre las interacciones entre hongos y plantas. En particular, estamos investigando el uso de hongos endófitos nativos como agentes de biocontrol de plagas de gusano blanco, aplicaciones biotecnológicas de hongos antárticos, y el uso de hongos para mejorar la salud de las abejas.

Actualmente, estamos trabajando en un proyecto FONDEF IDeA I+D en colaboración con el Dr. Esteban Basoalto y la Dra. Daniela Bustos (Instituto de Producción y Sanidad Vegetal), el Dr. Alejandro Jerez (Instituto de Farmacia) de la Universidad Austral de Chile, y la empresa Bio Insumos SPA (https://bionativa.cl). Además, participo como coinvestigador en un proyecto del INACH junto al Dr. Jaime Cabrera, de la Universidad de Utah (USA).

Contacto:

            E-Mail: sigisfredo.garnica@uach.cl

            Fono: +56 63 293849

            Dirección: Instituto de Bioquímica y Microbiología